OEGrid Toolkit C++ Programming Manual

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Contents

• 1. Introduction
  • 1.1 History
• 2. Theory
  • 2.1 Grids
  • 2.2 Accessing Data
    • 2.2.1 Spatial Coordinates
    • 2.2.2 Grid Indices
    • 2.2.3 Grid Element
  • 2.3 Storage
    • 2.3.1 Attaching to Molecules
• 3. Examples
  • 3.1 Grid Babel
• 4. OEGrid Classes
  • 4.1 OEScalarGrid
    • 4.1.1 Constructors
    • 4.1.2 operator=
    • 4.1.3 operator()
    • 4.1.4 operator[]
    • 4.1.5 Clear
    • 4.1.6 CreateCopy
    • 4.1.7 ElementToGridIdx
    • 4.1.8 ElementToSpatialCoord
    • 4.1.9 IsDataType
    • 4.1.10 GetDataType
    • 4.1.11 GetType
    • 4.1.12 GetDim
    • 4.1.13 GetMid
    • 4.1.14 GetSize
    • 4.1.15 GetSpacing
    • 4.1.16 GetTitle
    • 4.1.17 GetX
    • 4.1.18 GetXDim
    • 4.1.19 GetXIdx
    • 4.1.20 GetXInc
    • 4.1.21 GetXMax
    • 4.1.22 GetXMid
    • 4.1.23 GetXMin
    • 4.1.24 GetY
    • 4.1.25 GetYDim
    • 4.1.26 GetYIdx
    • 4.1.27 GetYInc
    • 4.1.28 GetYMax
    • 4.1.29 GetYMid
    • 4.1.30 GetYMin
    • 4.1.31 GetZ
    • 4.1.32 GetZDim
    • 4.1.33 GetZIdx
    • 4.1.34 GetZInc
    • 4.1.35 GetZMax
    • 4.1.36 GetZMid
    • 4.1.37 GetZMin
    • 4.1.38 GridIdxToElement
    • 4.1.39 GridIdxToSpatialCoord
    • 4.1.40 IsDataType
    • 4.1.41 IsInGrid
    • 4.1.42 IsSpacingSet
    • 4.1.43 IsTitleSet
    • 4.1.44 IsXMidSet
    • 4.1.45 IsYMidSet
    • 4.1.46 IsZMidSet
    • 4.1.47 SetAll
    • 4.1.48 SetDim
    • 4.1.49 SetMid
    • 4.1.50 SetSpacing
    • 4.1.51 SetTitle
    • 4.1.52 SetType
    • 4.1.53 SetXDim
    • 4.1.54 SetXMid
    • 4.1.55 SetYDim
    • 4.1.56 SetYMid
    • 4.1.57 SetZDim
    • 4.1.58 SetZMid
    • 4.1.59 SpatialCoordToElement
    • 4.1.60 SpatialCoordToGridIdx
  • 4.2 OESkewGrid
    • 4.2.1 Constructors
    • 4.2.2 operator bool
    • 4.2.3 operator=
    • 4.2.4 GetReentrant
    • 4.2.5 GetSpaceGroup
    • 4.2.6 GetUnitCell
    • 4.2.7 HasSpaceGroup
    • 4.2.8 HasUnitCell
    • 4.2.9 SetReentrant
    • 4.2.10 SetSpaceGroup
    • 4.2.11 SetUnitCell
• 5. OEGrid Functions
  • 5.1 OEAddContour
  • 5.2 OEClearGridBoundary
  • 5.3 OEGetContourColor
  • 5.4 OEGetContourLevel
  • 5.5 OEGetGridFileType
  • 5.6 OEGetGridFormatExtension
  • 5.7 OEGetGridFormatString
  • 5.8 OEGridGetRelease
  • 5.9 OEGridGetVersion
  • 5.10 OEGridHasNonZeroValue
  • 5.11 OEInitGridHandlers
  • 5.12 OEInterpolateBetweenGrids
  • 5.13 OEIsGrid
  • 5.14 OEIsReadableGrid
  • 5.15 OEIsWriteableGrid
  • 5.16 OEMakeGridFromCenterAndExtents
  • 5.17 OEMakeMolecularGaussianGrid
  • 5.18 OEMakeRegularGrid
  • 5.19 OEMakeRegularSubGrid
  • 5.20 OEMaskGrid
  • 5.21 OEMaskGridByCoordsAndRadii
  • 5.22 OEMaskGridByMolecule
  • 5.23 OEMaskGridValues
  • 5.24 OENumContours
  • 5.25 OEReadGrid
  • 5.26 OESigmaNormalizeGrid
  • 5.27 OEWriteGrid
• 6. Release Notes
  • 6.1 Grid 1.3.1
    • 6.1.1 Bug fixes
  • 6.2 Grid 1.3.0
    • 6.2.1 New features
    • 6.2.2 Bug fixes
  • 6.3 Grid 1.2.1
    • 6.3.1 New Features
    • 6.3.2 Bug Fixes
• Index

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Documentation released on June 4, 2008.