pKa実験値データベース/Experimental pKa Data
この pKa データベースは、既存の参考文献から有機酸、塩基(水中)の実験的に得られたpKa値を収録し、コンピュータ登録の、部分構造による検索可能なIUPACの編集版に非常に注意深く変換したものです。
Base 1 と Acid 1 データベースは、リリースされていますが、 Base 2 と Acid 2 データベースの変換は 現在進行中です。
データソース
- Base 1 (3775 分子, 8766 pKas)
Dissociation Constants of Organic Bases in Aqueous Solution, by D.D. Perin - Acid 1 (1063 分子, 2893 pKas)
Dissociation Constants of Organic Acids in Aqueous Solution, by G. Kortum, W. Vogel and K. Andrussow - Base 2 (~4300 分子)
Dissociation Constants of Organic Bases in Aqueous Solution, Supplement 1972, by D.D. Perin - Acid 2 (~4520 分子)
Ionisation Constants of Organic Acids in Aqueous Solution, by E.P. Serjeant and Boyd Dempsey
実際の変換作業は、精度と均一性を維持するために、Tony Slater 、 pKaData Limited、により、行なわれました。トートマー列挙には QUACPACが使用されています。
Features
データベースは Microsoft Excel および CSV フォーマットで配布されて、IUPACにより整理された既存のデータベースと簡単に融合できます。
- 分子名と構造の SMILESへの変換
- IUPAC 重要なデータ精度評価
- イオン強度、濃度、温度等の個別のデータ欄
- 検索機能の向上のため、数値でないデータの個別の欄へ収録 (例 <5.3 等は、2つの欄に分けて記載されています。)
- 各データの参照文献および実験方法の完全な記載
- logD 計算のためのイオン化設定