Third Party Software/第三者ソフトウェア
分子モデリング領域は幅広いため、我々の開発の手が届かない分野が数多くあります。そのためオープンアイは、他のソフトウェア開発業者がオープンアイのテクノロジーに基づいて製品を開発することを支援しています。
ソフトウェア
以下のソフトウェアは、オープンアイのソフトウェアとツールキットを用いて開発されたものです。:
- Umetricsにより開発されたSIMCA-P (Multivariate Data Analysis)の一部である Chemical Structure Displayは、Ogham TKを利用しています。
- Dimension 5, Ltd.により開発されたMiner3D Data Visualizerのプラグイン Chemical Structures plugin は、Ogham TKを利用しています。
- ReelTwo, Inc.により開発されたSureChem(特許検索ツール)は、Lexichem TKを利用しています。
- Mesa Analytics & Computing, LLCにより開発されたFingerprint Moduleは、OEChem TK
- Mesa Analytics & Computing, LLCにより開発された Shape Clustering Moduleは、Shape TKを利用しています。
- EduSoft, LCにより開発された ZAP! (Sybyl interface)は、Zap TKを利用しています。
データベース
以下のデータベースはオープンアイのソフトウェアとツールキットを用いて開発されたものです。
- NCBIによって構築された低分子化合物の活性と構造を含むPubChemは 、OEChem TK, Ogham TK, Lexichem TK and Quacpac TKなどの多数のオープンアイ・ツールキットを利用して作成されています。
- RCSBによって提供されているProtein Data Bank (PDB) ligand dictionaryは 、メンテナンスにOEChem TK、表示にOgham TKを用いています。
- Shoichet 研によって提供されているバーチャルスクリーニングに適した市販化合物の無料データベースZINCは、FILTER, OEChem TK, OMEGA、QUACPACを用いて構築され、Ogham TKにより表示されています。
- 3Dバーチャルスクリーニングに適した市販化合物の無料データベース RPBS's small molecule databasesは、FILTER OMEGAを用いて構築されています。
- ChemZoo, Incによって開発されたオンライン化学データベース及び特性予測サービスChemSpider.comは、OEChem TK, Lexichem TK Ogham TK, 及びFILTER QUACPACを利用しています。
